A Administração Superior da Universidade de Uberaba é composta pelo Conselho Universitário; Reitoria; Pró-Reitoria de Ensino Superior; Pró-Reitoria de Pesquisa, Pós-Graduação e Extensão; Pró-Reitoria de Educação a Distância; Pró-Reitoria Adjunta; Superintendência Administrativa; e Instituto Maria Modesto.

O Conselho Universitário, composto pela Câmara de Ensino Superior, Câmara de Pesquisa e Pós-Graduação, Câmara de Extensão e por membros da comunidade, é órgão normativo, instância de recurso e órgão deliberativo máximo da UNIVERSIDADE.