A Administração Superior da Universidade de Uberaba é composta pelo Conselho Universitário; Reitoria; Superintendência Administrativa; Pró-Reitoria de Ensino Superior; Pró-Reitoria de Pesquisa, Pós-Graduação e Extensão; Instituto de Formação de Educadores; e Instituto de Estudos Avançados em Veterinária.

O Conselho Universitário, composto pela Câmara de Ensino Superior, Câmara de Pesquisa e Pós-Graduação, Câmara de Extensão e Ação Comunitária, e por membros da comunidade, é órgão normativo, instância de recurso e órgão deliberativo máximo da UNIVERSIDADE.

O funcionamento do Conselho Universitário é regulado por regimento próprio, aprovado pelo mesmo.

O Conselho Universitário, órgão deliberativo superior da UNIVERSIDADE, é presidido pelo Reitor e constituído pelos seguintes membros:

a) Vice-Reitor;

b) Pró-Reitor de Ensino Superior;

c) Pró-Reitor de Pesquisa, Pós-Graduação e Extensão;

d) onze representantes do corpo docente das diferentes áreas de conhecimento, escolhidos por seus pares, sendo que, dentre os representantes, um docente é escolhido entre os Diretores de Institutos, e quatro entre os Diretores de Cursos;

e) três representantes dos alunos regulares, sendo dois alunos de cursos de graduação, indicados pelo Diretório Central dos Estudantes, e um aluno de cursos de pós-graduação, indicado por seus pares;

f) um representante do pessoal técnico-administrativo, designado pelo Reitor; e

g) três representantes da Comunidade, ou seus suplentes, escolhidos pelo Conselho Universitário, dentre as áreas socioeconômicas de atividades culturais, assistenciais e educacionais, comerciais e industriais, e agropecuárias, áreas essas que expressam a representatividade mais enfática da comunidade regional.